源於雪山山脉的栖兰山、莺子岭山之水源，各自形成南势溪、北势溪，穿过崇山峻岭奔流而下，於新店龟山地区汇流成新店溪，最终於板桥江子翠与大汉溪合为淡水河，流域面积广达910平方公里。水量丰沛、水质清澈的新店溪，供应了双北地区绝大部分的民生用水与部分电力，也是香鱼、毛蟹等洄游动物的家园。新店溪上游峡谷地势雄伟、曲流地形发达，新店区众多带有「潭」、「湖」字的地名，就是S型曲流地形里平阔水深之处，自上游顺流而下，共有燕子湖、梅花湖、蒙蒙湖、涂潭、直潭、湾潭、青潭、碧潭等处8处，合称「三湖五潭」。从南势溪下游的乌来红河谷启程，观赏壮阔的河谷地形，沿着台9甲公路顺流而下，游历文山农场、小粗坑生态绿廊、新店渡渡口，最後到碧潭鱼道，观察新店溪里逆流而上的洄游鱼蟹，回望新店的青山绿水。乌来红河谷旧称「加九寮」，是泰雅族语Sokalie的汉译，原意指「漩涡」，加九寮溪与南势溪在此交会，在湍急的水流与造山运动的交互作用下，大自然之手铸造出一大片岩层倾斜的河床与宽阔的溪谷，让红河谷获得「小太鲁阁」的美誉。从地标加九寮景观大桥俯瞰，可见到各式奇形怪状的高大巨石错落於溪谷当中，与碧绿的溪流相映成趣，清澈见底的溪水中有鱼虾自在悠游。走一段加九寮步道，平缓的路途上绿树成荫，与蝴蝶、树蛙结伴而行。沿着台９甲公路从乌来前往新店屈尺的文山农场，新店溪自农场北侧的屈尺山下蜿蜒而过，文山农场在日治时代是「茶业传习所」，成立以来一直致力於台湾茶叶产制与改良技术的工作，今日则由新北市农会经营，园区内设有露营区、野炊区、药用植物标本区、休闲活动区、茶艺区、制茶研习馆、农产品展售中心、儿童游戏区等，是新店热门的户外休憩区。农场内的重要地标－红砖制茶厂是台湾目前唯一保留烟囱的制茶厂，环绕於制茶厂周遭的山坡地种满了茶树，站在制高点甚至能远眺台北101大楼，参加农场举办的茶叶文化游程，体验从采茶、制茶、泡茶的甘苦。距离文山农场仅10分钟车程的小粗坑生态绿廊，在日治时期曾是运送煤矿、木材的轻便车道，具丰富的自然、人文景观。起点处的小粗坑发电厂，拥有巴洛克式风格的外观，启用於1909年，利用新店溪剧烈的高低落差，进行水利发电，是全台湾第二座水力发电厂，至今仍在使用中呢！小粗坑生态绿廊全长约1.8公里，绿廊全程傍着新店溪右岸而行，居高临下欣赏新店溪的秀丽美景，步道沿途种植大量非洲凤仙花、大花咸丰草等蝶类喜爱的花草，在花卉盛开时还能预见彩蝶飞舞的景象。续往下游进到湾潭地区，搭乘「摆渡」横渡新店溪，清代时因公路运输尚待发展，新店溪两岸的居民大多仰赖渡船作为主要对外的交通方式，在水上交通最发达时的时期，新店溪沿岸曾设有9个渡口，後因陆上交通改善而逐一废弃，始於1881年的新店渡渡口，是目前仅存的人力摆渡口。渡船费用大人30元，小孩15元，搭乘人力摆渡横渡新店溪，享受水岸轻舟之乐，低速细品湾潭、碧潭的美景，到对岸的湾潭游戏场、文学步道玩耍美拍，纪录这特别的水上之旅。新店溪的三湖五潭之中，碧潭是位处最下游的河段，也是新店溪离开山区进入盆地的分界线，碧潭宽阔的水域与便利的交通，是双北历久不衰的热门景点，站在河岸边，静静欣赏碧潭的湖光山色，享受这一刻的岁月静好。步行至碧潭大桥北侧的碧潭堰，这座兴建於1977的水利工程，目的是维持与调节碧潭的水位，却也阻断了新店溪里洄游类生物的迁徙之路，2015年碧潭堰遭到台风重创後进行重建，重建工程新增了生态鱼道，让40多年未见的「毛蟹洄游」再现新店溪，相当注重水质的香鱼也再度活跃於新店溪。碧潭鱼道设置观察窗及水下监测摄影系统，可24小时即时观察水中生物。利用鱼道的观察窗，观赏河流底层溯游活动的生物，如溪哥、石宾、花鳅、香鱼、毛蟹和虾子等等种类，也能见到看到一些河海洄游的物种，如汤鲤、鳗鱼、乌鱼等。新店溪於此进入台北盆地，将续行至江子翠与大汉溪共同注入淡水河奔流到海，在碧潭鱼道回望新店的群山，这片山川交融的风景，是新北水源与生态的宝藏之地。
